通常立式饮水机的消毒柜就“紫外线和臭氧”两种。紫外线哪种就是在柜里装有一小型紫外灯管，一般要30分钟左右才能有实际效果；臭氧消毒是内置有臭氧发生剂的，要定期更换，消毒完后至少要等30分钟才能打开，所以最好是在晚上睡前进行消毒为好。杯子的气味有两种可能，一、如果是塑料或仿瓷材质的，两种消毒方式都会或多或少的留有气味；二、就是臭氧消毒的通病，臭氧消毒后放置的时间越长，气味就越少，使用时最好把杯子取出放一两钟再用。

不知道你机器的品牌和型号是什么，但是从消毒后杯子上有气味判断，可能是臭氧消毒，也就是机器的储存柜里面安装了一个臭氧发生装置。可以直接使用杯子。

现在的立式饮水机一般都是带消毒功能的,也就是底部的柜体是消毒柜设计,原理是臭氧消毒:插电--旋动或者打开消毒开关--底部柜体里有个产生臭氧的方形小盒子,开始工作--可以消毒杯子等物品.用这个功能呢要在消毒完毕后等一个小时再开消毒柜的门为好,这样可以消除臭氧对环境的影响(气味).