水垢对人体健康影响绝对不容忽视，水垢容易造成肠胃消化和吸收功能紊乱及便秘，使胃炎及各类结石的发病率提高。牙垢、牙周炎经常由水垢引起;可致人死命。至今仍无疫苗可预防的军团病菌，就藏匿在水垢中。

1，氧化皮具有较差的导热性，这会导致加热表面上的热量传递恶化，浪费燃料或电力。

2，当水垢粘结时，经常粘附大量重金属离子。如果容器用于容纳饮用水，则存在重金属离子过度溶解于饮用水中的风险。

3，来自水垢的残留物进入胃并与盐酸反应释放出钙，镁离子和二氧化碳。第一种是形成宝石的必需物质。后者可使人更平坦和不舒服，胃溃疡患者也可能有胃穿孔的风险。